当今的通常一次处理多个样品，但是每个样品都必须进行处理而不受其他样品的影响。科学家必须确保没有交叉污染。这需要仔细控制气流。用户还必须保持其系统处于良好状态。保持针头清洁至关重要。如果针孔堵塞，孔将不会变干。在涉及酸的过程中，针可能会腐蚀并堵塞。有些系统使用不锈钢针头；其他人则使用聚四氟乙烯，因此必须为您的应用选择合适的针头。如果一个系统包括一个调节器，那么也必须对其进行维护。沸腾和起泡是蒸发过程中通常出现的问题，可能导致样品损失和污染。罪魁祸首是对特定的应用施加了过多的热量，过多的旋转速度或太多的真空。当样品快速沸腾和冒泡时，会发生碰撞，从而导致浓缩的产物溅出容器。另一方面，起泡是由表面活性剂引起的，表面活性剂可以存在于天然提取物以及人工制成的产物中。起泡比起泡要慢，并且泡沫往往会在蒸发瓶中停留更长的时间。
避免在蒸发过程中发生碰撞的传统方法是通过目视检查-只需观察样品蒸发器培养箱并调整真空压力以免发生碰撞。泡沫本身是无法避免的。它只能减少。减少泡沫的最常用方法是在出现泡沫时打开和关闭旋塞。减少问题的另一种方法是慢慢施加真空。”
通过这些方法，可以使用几种产物，这些产物可以减少发生隆起和起泡时的样品损失和污染，有助于完全消除隆起并最大程度地减少起泡。为了专门解决发泡问题，可以使用消泡剂，大容量烧瓶或专用的玻璃，它们为泡沫膨胀提供了更多的空间。一个简单的玻璃泡沫制动器可以帮助防止泡沫进入接收瓶。在蒸发过程中也经常使用颠簸捕集器，它是比主烧瓶小的第二烧瓶。这个额外的烧瓶放在主烧瓶的正上方，这样，如果发生颠簸，样品在被吸入或冷凝器的其余部分之前将被捕获在颠簸阱中。将防撞阱排成一行并不能减少撞撞，但可以防止样品流失。真空控制器离问题的根源越来越近。通过控制泵的速度，这些设备可以大大减少或消除碰撞的可能性。自动功能可用于感应溶剂的蒸气压并将其用作设定点。然后是泡沫传感器，该传感器检测蒸发瓶内的泡沫并为系统稍微充气，以确保泡沫破裂。泡沫传感器允许自动，无人值守蒸馏泡沫样品。
